Es la unidad orgánica encargada de suministrar, en forma oportuna, eficiente y adecuada, los medicamentos y productos destinados a la recuperación y conservación de la salud de los pacientes según prescripción médica; depende de la Dirección General y tiene asignados los siguientes objetivos funcionales:

a. Efectuar la selección, programación, dispensación y distribución de los medicamentos e insumos de uso clínico y/o quirúrgico, para la atención de los pacientes en Consulta Externa, Hospitalización y Emergencia.
b. Programar y requerir a la Oficina de Logística, el abastecimiento necesario para lograr el suministro oportuno de medicamentos a los servicios de Consultorio Externo, Hospitalización y Emergencia. durante las 24 horas del día, asegurando el stock de reserva según la naturaleza y el comportamiento de la demanda
c. Dispensar los medicamentos y materiales terapéuticos para los pacientes.
d. Preparar productos galénicos.
e. Garantizar y controlar la calidad de los preparados y especialidades farmacéuticas.
f. Controlar y supervisar la dispensación de drogas y narcóticos de uso controlado por la Ley y los organismos competentes.
g. Asegurar la adecuada conservación y seguridad de los medicamentos.
h. Mantener un sistema de registro y control de medicamentos y materiales terapéuticos.
i. Intervenir en la elaboración y cumplimiento del petitorio farmacológico.
j. Asegurar el cumplimiento de las Normas de Bioseguridad correspondientes.
k. Estimular, orientar y monitorear la investigación en el campo de su competencia y objetivos funcionales asignados, así como apoyar la docencia en el marco de los convenios correspondientes.
l. Evaluar en forma periódica el servicio a través de indicadores.